Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms