Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms