Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gcom1E9PZ54 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms