Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc8E9PWG2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms