Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gm3298E9PW80 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3298E9PW80 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms