Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms