Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms