Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcn1E9PVA8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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