Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms