Protein–RNA interactions for Protein: E0CYV9

1110002E22Rik, RIKEN cDNA 1110002E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110002E22RikE0CYV9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1110002E22RikE0CYV9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1110002E22RikE0CYV9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1110002E22RikE0CYV9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1110002E22RikE0CYV9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms