Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptrhd1D3Z4S3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptrhd1D3Z4S3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptrhd1D3Z4S3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptrhd1D3Z4S3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptrhd1D3Z4S3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptrhd1D3Z4S3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptrhd1D3Z4S3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptrhd1D3Z4S3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptrhd1D3Z4S3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptrhd1D3Z4S3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptrhd1D3Z4S3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptrhd1D3Z4S3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptrhd1D3Z4S3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptrhd1D3Z4S3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptrhd1D3Z4S3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptrhd1D3Z4S3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptrhd1D3Z4S3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptrhd1D3Z4S3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptrhd1D3Z4S3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptrhd1D3Z4S3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptrhd1D3Z4S3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptrhd1D3Z4S3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptrhd1D3Z4S3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptrhd1D3Z4S3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptrhd1D3Z4S3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptrhd1D3Z4S3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptrhd1D3Z4S3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptrhd1D3Z4S3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptrhd1D3Z4S3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptrhd1D3Z4S3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptrhd1D3Z4S3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptrhd1D3Z4S3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms