Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim12cD3Z3L3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms