Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc8D3YZV8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms