Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms