Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Samd1D3YXK1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms