Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms