Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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