Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmf1B9EKI3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms