Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CatipB9EKE5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CatipB9EKE5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CatipB9EKE5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatipB9EKE5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatipB9EKE5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatipB9EKE5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatipB9EKE5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatipB9EKE5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatipB9EKE5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatipB9EKE5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatipB9EKE5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatipB9EKE5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatipB9EKE5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatipB9EKE5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatipB9EKE5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatipB9EKE5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatipB9EKE5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatipB9EKE5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatipB9EKE5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CatipB9EKE5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CatipB9EKE5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms