Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cttnbp2B9EJA2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms