Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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