Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms