Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cspp1B2RX88 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms