Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah3B2RWG3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms