Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms