Protein–RNA interactions for Protein: B2RR88

Zfp964, EG636741 protein, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp964B2RR88 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp964B2RR88 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp964B2RR88 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp964B2RR88 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp964B2RR88 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp964B2RR88 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp964B2RR88 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp964B2RR88 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp964B2RR88 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp964B2RR88 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp964B2RR88 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp964B2RR88 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp964B2RR88 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp964B2RR88 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp964B2RR88 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp964B2RR88 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp964B2RR88 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp964B2RR88 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp964B2RR88 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp964B2RR88 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp964B2RR88 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms