Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H60cB1B213 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H60cB1B213 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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H60cB1B213 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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H60cB1B213 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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H60cB1B213 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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H60cB1B213 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H60cB1B213 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H60cB1B213 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H60cB1B213 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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