Protein–RNA interactions for Protein: B1AZQ8

Cldn34b1, Claudin 34B1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b1B1AZQ8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms