Protein–RNA interactions for Protein: B1AZ99

Otud3, OTU domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud3B1AZ99 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud3B1AZ99 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms