Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NhsB1AV60 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms