Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem235B1AQL3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem235B1AQL3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem235B1AQL3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem235B1AQL3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem235B1AQL3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem235B1AQL3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem235B1AQL3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem235B1AQL3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem235B1AQL3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem235B1AQL3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem235B1AQL3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem235B1AQL3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem235B1AQL3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem235B1AQL3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem235B1AQL3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem235B1AQL3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem235B1AQL3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem235B1AQL3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms