Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprsB0V2N1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms