Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms