Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr16A3KMN5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prr16A3KMN5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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