Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms