Protein–RNA interactions for Protein: A2J008

Trgv2, MCG146472 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trgv2A2J008 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trgv2A2J008 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms