Protein–RNA interactions for Protein: A2BFE8

Prrg1, Proline-rich Gla (G-carboxyglutamic acid) 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrg1A2BFE8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prrg1A2BFE8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrg1A2BFE8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms