Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms