Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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