Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll9A2APC3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms