Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms