Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Frmpd1A2AKB4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms