Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34dA2AGU5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms