Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms