Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms