Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
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