Protein–RNA interactions for Protein: A2A884

Hivep3, Transcription factor HIVEP3, mousemouse

Predictions only

Length 2,348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep3A2A884 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hivep3A2A884 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms