Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calcoco2A2A6M5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms