Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cul4bA2A432 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul4bA2A432 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms