Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ccdc194A0A140LIT1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ccdc194A0A140LIT1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ccdc194A0A140LIT1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ccdc194A0A140LIT1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ccdc194A0A140LIT1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ccdc194A0A140LIT1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ccdc194A0A140LIT1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ccdc194A0A140LIT1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ccdc194A0A140LIT1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ccdc194A0A140LIT1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ccdc194A0A140LIT1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ccdc194A0A140LIT1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ccdc194A0A140LIT1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ccdc194A0A140LIT1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc194A0A140LIT1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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